제66기지(Site-66)는 원래 SCP-1479 주위에 제66가설기지로 세워졌으며, 이후 확장되어 생물학적 및 유기적 변칙 존재들을 격리하고 연구하는 임무를 맡고 있다. 이 시설에 격리된 SCP로는 SCP-478, SCP-569, SCP-646, SCP-806, SCP-886 등이 있다.